一、教学理念和授课方式的不同
公办普高在教学理念上，主要偏向于传统模式。其中，教学内容和授课方式都比较传统，通俗的讲，就是“一切都以文化课成绩为准“，少数学校会开设”特色专业班“。以杭州市区的公办普高为例，其中长征中学就设有“音乐班”，杭七中就设有“美术班”等，但是总体占比微乎其微。
民办普高在教学理念上，偏向于全方面的教学模式。其中，比较有特点的就是开设多种特色教学班级，教学授课方式比较多样化，比较新颖。举例，比如杭州绿城育华学校，就开设的多种外语特色课程教学的班级，以及各类选修课程，培养学生的自主学习习惯和拓展潜在学习目标。
二、费用和奖学金制度的不同
公办普高的教师工资都是由政府财政支处，学校的办学经费也是由政府划拨，所以向学生收取费用都比较低，坊间有俗语就是“读民办几乎不缴费”这一说法。
民办普高的所有经营费用，包括办学费用和教师工资，都是由学校自主运营的。所以，经营费用主要源于向学生收取的学费，费用相较于公办普高，会高出不少。另外，民办普高收费标准也并不统一，不同民办普高收取费用标准也不同。但是，这里值得一提的是，绝大多数民办普高为了打造良好的学习竞争氛围，都会设立奖学金制度。学生通过学习考出优异的成绩，学校给予不同程度的奖励，以激励学生学习的积极性。
